Après avoir récupéré Edens Zero, le cuirassé du Grand Démon, et retrouvé leur amie Witch, Shiki, Rebecca et Happy rendent visite à leurs compagnons pour reformer l'équipage du vaisseau. Dans cette situation, très différente de celle d'avant, Shiki cherche à sympathiser avec ses anciens ennemis Drakkhen Joe et Poséidon Shura.