Les plus grands héros du monde, la Ligue des Justiciers, ont mystérieusement disparu et un terrifiant fantôme a élu domicile dans leur célèbre quartier général, le Hall de la Justice ! C'est maintenant au tour des plus grands super-savants du monde, Scooby et sa bande, de résoudre le mystère et de sauver nos héros... avec l'aide de leur nouveau copain Krypto le superchien !