Le spectacle de la cérémonie de remise des diplômes a été un grand succès, et Mikan et ses amis passent sans problème dans la classe au-dessus. Avec la nouvelle année scolaire, le conseil des élèves met en place une "Section Disciplinaire" qui surveille les élèves, ce qui fait régner une atmosphère menaçante sur toute l'Académie. Sur ces entrefaites, une nouvelle élève, Luna Koizumi, arrive dans la classe B !