Le détective Conan poursuit ses enquêtes et résout des affaires mystérieuses. Un jeu d'enquête policière est organisé dans le train que prend Conan. Ses amis et lui ouvrent une cabine désignée pour être le lieu d'un crime et tombent sur un malfaiteur qui s'enfuit aussitôt. Alors qu'ils perdent sa trace, les enfants apprennent que le jeu n'a pas encore commencé.